Első szólóalbuma - Introducing Wayne Shorter - 1959-ben látott napvilágot. Öt év múlva már a legendás Miles Davis zenekarához szerződött; vele lett teljes a klasszikus Miles Davis Quintet, amelyet máig a jazztörténet egyik legfontosabb együttesének tekintenek. A Miles Davis Quintettel is később örökzölddé érett szerzemények sokaságát jegyezte; köztük volt a Nefertiti, az E.S.P., a Pinocchio, a Sanctuary, és a Davis névjegyeként is emlegetett Prince of Darkness.
1970-ben Shorter régi kollégájával, Joe Zawinullal megalapította a Weather Reportot, amely sokak szerint a jazz-rock, majd fusion címkét viselő stílus és korszak legmeghatározóbb formációja volt. A bandát elhagyó Shorter a továbbiakban is fusion-albumokat adott ki saját, változó felállású zenekarával, illetve Carlos Santana gitárossal turnézott.
2001-ben gyűjtötte maga köré azokat a nála egy-két generációval fiatalabb, rendkívüli tehetségű muzsikusokat, akikkel a mai napig koncertezik és lemezfelvételeket készít. A kvartettben Danilo Perez zongorázik, John Patitucci bőgőzik, és Brian Blade dobol. A magyar közönség az új évezred legelején a debreceni jazz napokon, majd 2007-ben a Veszprémi Ünnepi Játékokon találkozhatott velük. Budapesten Wayne Shorter mindeddig csak más formációban mutatkozott.
Március 18-án, a Művészetek Palotájában is számítani lehet rá, hogy egyes, a korábbi évtizedekben klasszikussá vált Shorter-darabok teljesen átdolgozva, szabadon értelmezve, a tagok kollektív improvizációja által újrateremtve kelnek életre, és a leheletfinom, laza szövetű megszólalásoktól egészen az extázisig fokozott hangulatig és kirobbanó hangözönökig jut majd el a négy hangszeres fenomén.
