A múzeum története 1904. november 27-ig nyúlik vissza, amikor még Pécsi Városi Múzeumként nyitotta meg első állandó kiállítását. Mai nevét 1951-ben kapta, azóta pedig hazánk egyik meghatározó múzeumává fejlődött. A magyar képző- és iparművészet, néprajz, régészet, természettudomány, helytörténet országosan is kiemelkedő gyűjteményét őrzi és tárja a látogatók elé a számos kiállítóhelyén.
Az elkövetkező időszakban az intézmény számos kiállítását díjmentesen fedezhetik fel az érdeklődők. Rendhagyó programsorozat keretében a Janus Pannonius Múzeum tárlatvezetéseket tart, sőt a látogatók ezúttal még a belépőjegyre is az intézmény vendégei.
