Závogyán Magdolna öt évre szóló kinevezését 2013. március 26-án vette át az Emberi Erőforrások Minisztériumában. Závogyán Magdolna 2012. július közepe óta megbízott főigazgatóként irányítja az országos háttérintézményt. Az elmúlt kilenc hónap alatt megkezdődött az intézet átszervezése, konszolidációja, a jogutód intézmény megalapítása, valamint a területi módszertani feladatellátó szervezetek integrálása.
A főigazgató célja, hogy a Nemzeti Közművelődési és Közgyűjteményi Intézetet erős, innovatív háttérintézménnyé alakítsa át, amely megfelelő válaszokat tud adni a mai kor társadalmi és közművelődési kihívásaira. Ennek érdekében dinamikus, projekt-alapú munkaszervezetet állít fel. A háttérintézményi feladatok új elemekkel egészülnek ki, melyek között kiemelt fontosságú a stratégiai háttéranyagok készítése, az uniós pályázatokkal kapcsolatos szolgáltatások biztosítása, a projektgenerálás és a projektszemlélet meghonosítása, továbbá a közművelődés érdekérvényesítő szerepének megerősítése.
Závogyán Magdolna 2012 júliusáig a Békés Megyei Önkormányzati Hivatalban dolgozott kulturális referensként. Feladatai között szerepelt a megyei közművelődési, közgyűjteményi és előadó-művészeti intézmények ? művelődési központ, levéltár, könyvtár, múzeum, színház, bábszínház, szimfonikus zenekar ? fenntartói szintű szakmai felügyelete, koordinációja, és az ágazattal összefüggő megyei stratégiák elkészítése.