Az első ütemmel párhuzamosan végzik a 2011 tavaszán aláírt újabb támogatási szerződéssel lekötött, közel kétmilliárd forint költségű munkálatokat. Ennek során többek között restaurálják a kínai lakk kabinetet, a fogadótér és a porcelánszoba falképeit, elvégzik a télikert szintsüllyesztését, a gránátos házak homlokzati felújítását, elkészül a fogadóépület, amelyben az üzemeltetéshez kapcsolódó funkciók mellett szolgáltató és vendéglátó terek létesülnek, és helyreállítják a Bábszínház?Narancsház épületegyüttesét, valamint a hozzá kapcsolódó földszintes szárnyat is.
Ugyancsak idén kezdődik a magyar Versailles-nak is hívott épület három fontos parkrészének, az angolkertnek, az északi park nyugati területének és a rózsakertnek a revitalizációja, amelyre 200 millió forint áll rendelkezésre. Ez utóbbiban a helyreállítás után 20 000 rózsatő pompázhat, a magyar rózsafajták legteljesebb gyűjteményének adva helyet. A második ütem és a park rendezésének munkálatai várhatóan 2013-ban zárulnak.
Szintén az Új Széchenyi Tervben rendelkezésre álló forrásokat céloz meg a Kisalföldi Erdőgazdaság Zrt.-vel együtt kimunkált terv, amely a kastélytól délre elterülő történeti parkrész, a Lés-erdő és a kastélypark közös hasznosításának kialakítását célozza meg.
A magyar épített örökség egyik kiemelkedő, jelentős szellemi örökséget is hordozó műegyüttese, a fertődi Esterházy-kastély eddig mintegy 4 milliárd forint támogatást nyert. Amennyiben az újabb projekttervek is sikeresek lesznek, Fertőd?Eszterházán 2013-ig mintegy 5 milliárd forintos helyreállítási és fejlesztési beruházás valósulhat meg. A Nemzeti Erőforrás Minisztérium Kultúráért Felelős Államtitkársága támogatja a Műemlékek Nemzeti Gondnokságának projektszemléletű munkáját, mivel a kastély rehabilitációja úgy szolgálja az értékek megőrzését és hasznosítását, hogy párhuzamosan turizmust fejleszt, munkahelyeket teremt, és az egész térség fejlődésére pozitív hatást fejt ki.